البداية كانت في شهر نوفمبر، كان ارتفاع أسعار أجهزة الكمبيوتر في اليمن وغياب الوعي التنظيمي في أذهان رجال الأعمال من أهم الصعوبات أمام قرار تأسيس أول شركة وطنية متخصصة في تطوير وتسويق البرمجيات، على مدى عامين تقريباً استمرت يمن سوفت في تعليمات الهيكل التنظيمي الإداري والمالي لمنتجات الشركة وتحسين كوادرها واستثمار كل ذلك قبل البدء في أي نشاط تسويقي.

وعندما بدأ العميل في استخدام أنظمة يمن سوفت بعد مرحلة التأسيس، اكتسبت يمن سوفت ثقة عملائها في عدة قطاعات على مختلف المستويات نتيجة للوفاء بالالتزام والتجاوب مع احتياجات العملاء والسوق بالإضافة إلى المرونة في تحديث الأنظمة باستمرار.
في تلك المرحلة ضاعفت الشركة عدد موظفيها من مبرمجين وفنيين ومدربين واستشاريين يقدمون خدمات ما بعد البيع.
عمل فريق عمل يمن سوفت على تمكين العملاء من استخدام الأنظمة وكسر حاجز الخوف من التعامل مع التكنولوجيا.

ومنذ أكتوبر 1996 اكتسبت شركة يمن سوفت ثقة الجهات المانحة وشركاء التنمية في اليمن نظراً لإنجازها في تطوير أنظمة الفوترة لمشاريع إمدادات المياه بجودة عالية ومعايير علمية. وفي منتصف عام 1999 بدأت يمن سوفت العمل وفقاً لإجراءات معايير الجودة العالمية.

وواصلت شركة يمن سوفت إنجازاتها عندما تفوقت على العديد من الشركات الكبرى وفازت في يونيو 2002 بمناقصة تنفيذ النظام المحاسبي والمالي الحكومي الذي تم تمويله من البنك الدولي مما يثبت كفاءة خبراء يمن سوفت.